대체 스플라이싱 조절을 위한 2차 RNA 구조의 분자적 인식 메커니즘

대체 스플라이싱은 하나의 유전자가 여러 종류의 다양한 mRNA 아이소폼을 만들어내는 과정이며, 이 과정에서 특정 2차 RNA 구조는 스플라이싱 조절 복합체의 모집을 통해 최종 전사체 형태를 결정짓습니다.

구조 인식 기반 스플라이싱 조절

• 구조적 인식: RNA 결합 단백질(RBP)들은 pre-mRNA의 특정 2차 RNA 구조(예: Hairpin loop)를 직접적으로 인식하여 결합하며, 이는 스플라이소좀의 활성 부위를 국소적으로 조정합니다.
• 조절 기전: 이러한 RBP-구조 상호작용은 스플라이싱 효율을 높이거나 낮추어 대체 스플라이싱의 선택성을 부여합니다. 예를 들어, 특정 구조가 Exonic Splicing Enhancer (ESE) 부위의 접근성을 변경할 수 있습니다.

최근에는 초고해상도 분석 기법을 이용하여 in vivo 환경에서 RNA 구조가 어떻게 전사 후 처리 과정에 영향을 미치는지 규명하려는 시도가 진행 중이며, 이는 RNA-단백질 상호작용 매핑 연구의 중요한 축을 담당합니다.